超声波清洗机使用的清洗剂通常可分为溶剂清洗剂和水基清洗剂

1、水基清洗剂是以水为基质的清洗产品，超声波清洗机使用过程中所选用的清洗剂一般以水基型的清洗剂为主，水基清洗剂如果不具备防锈功能则加快了金属资料的生锈，原因是清洗后将表面的维护层去掉了会加快生绣。如果对防锈有要求则应该选用带防锈功能的水基清洗剂，凡事有利也有弊，如果水基产品增加带防锈的一些成份，这些成份又有可能降低水基清洗剂的清洗功能，其清洗力可能会下降。

水基清洗剂与有机溶剂为基质的产品相比有很多优点，例如价格便宜，使用安全方便等。水基清洗剂最大的不同还是使用超声波清洗机清洗完毕之后需要进行漂洗和干燥，而这些步骤通常需要投入新设备。这些设备既可应用于大规模的生产也使用于小批量的应用。这种设备的投资回报通常少于一年，在此之后，它就可成为真正节省成本的清洗方法。所以如果超声波清洗机在使用中要求清洗费用较低，对清洗的挥发也没有要求，对防锈不敏感，则可选用水基类型的清洗剂。

2、溶剂清洗剂一般指可快速挥发的有机物质溶剂，主要分为碳氢化合物和氯化有机物。碳氢化合物溶剂具有相对较低的毒性，较好的材料兼容性以及多种的挥发率和多温度的燃点。氯化有机溶剂毒性相对较大，材料兼容性较差，但它们可快速干燥并且不易燃烧。在大规模生产时，这两种有机溶剂一般均需要专业的超声波清洗机以满足防毒的需要或由于其燃点而引发的问题。

溶剂清洗剂优点在于清洁度高，不用干燥，溶剂本身可通过蒸馏再生循环使用，另外解决了水基清洗剂废液处理困难的问题，不需作废液处理设备的额外投资。如果清洗的对象要求挥发快，清洗效率高，且具有防锈的要求即可考虑选用溶剂清洗剂。缺点是成本高, 易燃, 此外溶剂的气味对于工作环境会有影响，尤其是使用不封闭的半自动超声波清洗机时。